Зуб денисова человека, из которого удалось выделить ДНК. Этот зуб принадлежал молодому мужчине, который обосновался в  Денисовой пещере 50 тыс. лет назад. И этот человек не был ни неандертальцем, ни человеком современного вида. Но, тем не менее, как показал анализ генома, этот третий вид Homo sapiens подарил нам важную часть нашего иммунитета.

Всего несколько лет назад ученые были уверены, что современный человек разумный  лишь через общего предка связан с неандертальцами  Но после расшифровки ископаемых ДНК оказалось, что между ними были-таки “смешанные браки”. Но и этого мало, в 2008 году на Алтае был открыт еще один вид человека разумного — денисовский (денисов) человек, который по своему геному отличался и от нас, и от неандертальцев, и все три вида между собой могли скрещиваться. Сейчас же начинают выясняться подробности обмена генами между денисовцами, неандертальцами и людьми современного вида…

2010 год принес два великих палеоантропологических открытия — была закончена первая расшифровка генома неандертальцев, живших 30 тысяч лет назад на территории Европы, и расшифрованы ДНК денисова человека — нового вида человека разумного, открытого за два года до этого в Сибири (1,2).

Прочтение ядерного генома неандертальца позволило установить, что наши популяции разделились 270–440 тыс. лет назад. Затем от неандертальцев отделились денисовцы.

На данный момент от денисова человека имеются всего два достоверных фрагмента: фаланга мизинца, принадлежавшая девочке, и зуб молодого мужчины. Однако они очень хорошо сохранились и из них удалось выделить достаточное количество генетического материала, чтобы с очень высокой долей вероятности определить находки из Денисовой пещеры как принадлежащие отдельному виду homo sapiens.

Все три вида человека разумного имели общего предка в Африке, но мигрировать они начали из неё в разное время и независимо друг от друга — неандертальцы ушли в Европу и западную часть Азии, а денисов человек в Восточную Азию. Лишь 65 тыс. лет назад предки современного человека разумного (homo sapiens sapiens) также покинули Африку и быстро распространились по всей территории Евразии.

Данные генетического анализа однозначны — все три вида не просто жили многие тысячелетия рядом друг с другом, но и вступали в половую связь, и частичными потомками этих связей являются почти все жители Земли (за исключением части населения Африки).

В геноме современного человека обнаруживается до 4% генов неандертальцев, схожая ситуация с денисовым человеком — в отдельных современных популяциях находится до 6% генов денисовцев.

Раскопки в Денисовой пещере были начаты в 1977 году. Оказалось, что человек начал в ней останавливаться 300 тыс. лет назад. Всего же было найдено 20 культурных слоев из всех эпох человеческой истории. Самым же значительным открытием стали находки останков денисова человека.

Генетики только-только начали разбираться, какие же именно гены общие у современного человека и его ближайших родственников. И почти сразу удалось выяснить, что среди них — важнейшие гены иммунной системы – гены HLA класса I, которые играют ключевую роль в способности распознавать и уничтожать чужеродные белки. Серия материалов на эту тему опубликована журналом Science (1,2,3).

Система HLA (человеческие лейкоцитарные антигены) – это комплекс белков, отвечающий за тканевую совместимость. Аналогичные комплексы есть в иммунной системе всех млекопитающих, но HLA – сугубо человеческое приобретение. Эти гены – одни из наиболее изменчивых в нашем геноме, что указывает на их недавнее эволюционное приобретение.

У HLA множество различных ролей. Они важны в защите от болезней, могут быть причиной отторжения органов после пересадки, могут защищать от рака или увеличивать его вероятность (если разрегулированы из-за частых инфекций). Они могут влиять на развитие аутоиммунных заболеваний (например, диабет первого типа). Кроме того HLA могут быть связаны с некоторыми индивидуальными запахами, играющими роль при выборе половых партнеров… Разнообразие HLA в человеческой популяции является одним из аспектов защиты от болезней, и, следовательно, шансы совпадения всех генов HLA на всех локусах очень невелики. Изначально HLA гены были идентифицированы при успешных трансплантациях органов между людьми с похожими HLA.

Команда Питера Пэрхэма (Peter Parham), профессора микробиологии и иммунологии из Стэнфордского университета, изучила ген HLA-B*73 , который очень редок в популяции современных африканцев, но обычен среди населения Восточной Азии. Это навело их на мысль, что ген получен человеком сравнительно недавно, из более древнего генома, и произошло это вне Африки. С расшифровкой генома денисова человека стало ясно, что именно этот вид снабдил современного человека геном HLA-B*73. А поскольку это произошло в Восточной Азии, то частота этого гена осталась в популяции как память о контактах с денисовцами.

Другой вариант гена, HLA-A*11, также отсутствующий у африканцев, повсеместно распространен среди жителей Восточной Азии и Океании и особенно – у Папуа Новой Гвинеи. Что не удивительно, учитывая, что именно у населения Меланезии встречается до 5,5% денисовских генов.

Такая же история произошла и с другими вариантами генов HLA, которых нет в африканской популяции, но они распространены среди европейцев. Анализ показал, что эти гены современный человек получил от неандертальцев. Причем возможно, что и гены от денисова человека современные жители Европы и западной части Азии также получили посредством неандертальцев…

Таким образом, близкие контакты наших непосредственных предков с другими видами хомо сапиенс были для них крайне полезны — защитная система homo sapiens sapiens значительно окрепла. Как заключают авторы публикации в Science: «само формирование современной иммунной системы человека обязано архаическим аллелям, полученных от других видов людей»…